系統集成是HIS發展到一定階段的必然需求，通過集成實現各個業務信息系統間流程通暢、業務協同、數據共享、集中高效信息平臺。早期的點對點集成方式已經不能適應日漸繁雜的HIS，當前系統集成技術可以采用集成平臺技術或互操作性技術。

       集成平臺技術采用SOA集成體系，它將軟件的功能設計成一個個獨立封裝的服務，并通過信息交換協議進行發布，達到無界限的聯通和軟件復用。SOA模式可以通過企業服務總線（ESB）實現，ESB將總線上的各個服務按照用戶需要的業務邏輯組裝起來，使這些服務按照業務邏輯順序執行，從而實現用戶完整的業務功能。

       互操作性（Interoperability）技術則是在現有HIS的基礎上，通過標準化改造，在共同遵循數據、內容、標識、交換和功能等醫療衛生信息標準的基礎上，產生互操作規范，采用交互引擎，實現系統間業務協同和數據共享。

       臨床數據中心CDR實際上也是一種集成的應用。CDR將各個系統產生的醫療業務、臨床和管理數據按照規范標準進行提取和存儲，集中供HIS用戶調用。CDR是醫院為支持臨床診療和管理，以病人為索引構建的數據存儲結構，是基于電子病歷的醫院信息平臺的數據中心。

      隨著HIS的發展，電子病歷的地位越來越重要。電子病歷系統高水平應用主要包括幾個方面：

（1）建立覆蓋臨床診療全過程的醫療信息化管理，逐步形成內容完整的電子病歷；

（2）建立完整的個人電子病歷，包括在不同醫院、不同時期、動態更新的電子病歷；

（3）充分利用合理用藥、臨床路徑、循證醫學、診療指南等醫學和診療知識庫，輔助診療決策以及精準醫療的應用；

（4）專科電子病歷與專科CDR的開發與應用；

（5）達到高級別的電子病歷系統功能應用水平評級。

       以往條塊分割的管理子系統已經不能適應現代醫院管理的要求，各種新技術、新方法的應用，以及醫院信息化建設的整體發展，推動著醫院資源管理從粗獷型管理向精細化管理跨越發展。企業資源規劃ERP將廣泛用于醫院管理，形成醫院資源規劃HRP應用。

      HRP采用ERP的管理思想和技術，融合現代醫院管理理念和流程，整合所有醫院管理信息資源，創建的一套支持醫院整體運營管理的高效統一、互聯互通、集成共享的醫院資源管理平臺。HRP涵蓋了醫院物資資源管理、人力資源管理、財務資源管理、信息資源管理和知識資源管理。HRP關注資源的整體利用、效益、質量和安全，是現代醫院的一體化資源管理平臺。

      醫院信息標準化的程度反映了醫院信息化的整體水平，尤其是參與區域醫療和“互聯網+醫療”的能力和水平。信息標準化包括標準的制定、修訂和實施的全過程，醫院信息標準化的重點則是相關標準的實施和落地。

      醫院信息標準化建設包括：

（1）醫療衛生信息標準的應用與推廣；

（2）醫院信息標準化實施和應用人員培訓；

（3）新建信息系統應遵循現有標準；

（4）實行醫院信息標準化程度測評。

       從醫療衛生標準化體系的高度，審視、指導和規劃醫院信息化建設，能夠獲得更開闊的視野、更準確的把握、更有效的實施。

      與傳統的實體醫院不同，互聯網醫院是以云計算方式向用戶（包括醫務人員、患者等）提供服務。 現有的HIS將通過高度融合移動互聯網、云計算、大數據和物聯網等“互聯網+”新技術，形成Internet HIS（互聯網醫院信息系統）。

       隨著國家對“互聯網+醫療”新模式、新業態的支持和推進，互聯網診療和藥品監管的進一步完善，HIS將全面支持基于互聯網的在線醫療衛生新模式。同時HIS將逐步對第三方互聯網平臺開放醫療信息資源，支持第三方建立醫療信息數據共享平臺。患者可以通過在線醫療平臺獲得相關醫療服務，極大地方便了群眾就醫，也大大地擴展了醫院的服務范圍。